دوره 33، شماره 6 - ( شهریور 1404 )
جلد 33 شماره 6 صفحات 9134-9124 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Kalhor H, Siroosi M. Identification of Phenazines with Potential Inhibitory Activity against OXA-48 Carbapenemase by Using Molecular Docking Approach to Combat Antibiotic Resistance. JSSU 2025; 33 (6) :9124-9134
URL: http://jssu.ssu.ac.ir/article-1-6375-fa.html
URL: http://jssu.ssu.ac.ir/article-1-6375-fa.html
کلهر حوریه، سیروسی مریم. شناسایی فنازین‌های با عملکرد بالقوه مهارکنندگی آنزیم کارباپنماز OXA-48 با رویکرد داکینگ مولکولی جهت مقابله با مقاومت آنتی‌بیوتیکی. مجله علمي پژوهشي دانشگاه علوم پزشكي شهید صدوقی يزد. 1404; 33 (6) :9124-9134
چکیده: (154 مشاهده)
مقدمه: : مقاومت آنتی‌بیوتیکی، به‌ویژه مقاومت به کارباپنم‌ها، یکی از چالش‌های عمده در حوزه سلامت جهانی است و آنزیم کارباپنماز OXA-48 نقش مهمی در ایجاد این مقاومت ایفا می‌کند. بنابراین در این مطالعه، از رویکردهای اتصال مولکولی برای شناسایی ترکیبات جدید برای مهار آنزیم کارباپنماز OXA-48 استفاده شد.
روش بررسی: این پژوهش به روش توصیفی-تحلیلی انجام شد. برای بررسی نحوه اتصال ترکیبات فنازین انتخاب شده، در ابتدا ساختار کریستالی کارباپنماز OXA-48 از بانک اطلاعات پروتئین استخراج و توسط نرم‌افزار AutoDock Tools4.2 آماده‌سازی شد. سپس ساختار شیمیایی ترکیبات از پایگاه داده PubChem دریافت شده و توسط نرم‌افزار Chem Draw(3D) بهینه‌سازی شدند. در مرحله آخر داکینگ مولکولی توسط نرم‌افزار AutoDock Vina انجام شد.
نتایج: بر اساس نتایج به دست آمده از مطالعات داکینگ، مهم‌ترین پیوندهای درگیر در اتصال ترکیبات فنازین با آنزیم کارباپنمازOXA-48 ، اتصالات هیدروفوبی بودند. در میان تمام ترکیبات مورد مطالعه، بهترین نتایج داکینگ مربوط به ترکیبات Aotaphenazine، PhenazinolinE و BaraphenazineD بود. این ترکیبات به ترتیب با انرژی تمایل 9/9-، 9/6- و 9/6- کیلوکالری بر مول تمایل بیشتری برای اتصال به آمینواسیدهای کلیدی جایگاه فعال آنزیم نشان دادند.
نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج داکینگ مولکولی می‌توان نتیجه گرفت که ترکیبات فنازینی انتخاب شده به‌ویژه ترکیبات Aotaphenazine، PhenazinolinE و BaraphenazineD می‌توانند به عنوان مهارکننده‌ی بالقوه آنزیم کارباپنماز OXA-48 در نظر گرفته شوند. با این‌حال، تأیید اثر درمانی این ترکیبات نیازمند مطالعات آزمایشگاهی و بالینی است.
روش بررسی: این پژوهش به روش توصیفی-تحلیلی انجام شد. برای بررسی نحوه اتصال ترکیبات فنازین انتخاب شده، در ابتدا ساختار کریستالی کارباپنماز OXA-48 از بانک اطلاعات پروتئین استخراج و توسط نرم‌افزار AutoDock Tools4.2 آماده‌سازی شد. سپس ساختار شیمیایی ترکیبات از پایگاه داده PubChem دریافت شده و توسط نرم‌افزار Chem Draw(3D) بهینه‌سازی شدند. در مرحله آخر داکینگ مولکولی توسط نرم‌افزار AutoDock Vina انجام شد.
نتایج: بر اساس نتایج به دست آمده از مطالعات داکینگ، مهم‌ترین پیوندهای درگیر در اتصال ترکیبات فنازین با آنزیم کارباپنمازOXA-48 ، اتصالات هیدروفوبی بودند. در میان تمام ترکیبات مورد مطالعه، بهترین نتایج داکینگ مربوط به ترکیبات Aotaphenazine، PhenazinolinE و BaraphenazineD بود. این ترکیبات به ترتیب با انرژی تمایل 9/9-، 9/6- و 9/6- کیلوکالری بر مول تمایل بیشتری برای اتصال به آمینواسیدهای کلیدی جایگاه فعال آنزیم نشان دادند.
نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج داکینگ مولکولی می‌توان نتیجه گرفت که ترکیبات فنازینی انتخاب شده به‌ویژه ترکیبات Aotaphenazine، PhenazinolinE و BaraphenazineD می‌توانند به عنوان مهارکننده‌ی بالقوه آنزیم کارباپنماز OXA-48 در نظر گرفته شوند. با این‌حال، تأیید اثر درمانی این ترکیبات نیازمند مطالعات آزمایشگاهی و بالینی است.
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
میکروبیولوژی
دریافت: 1403/11/9 | پذیرش: 1403/12/19 | انتشار: 1404/6/15
دریافت: 1403/11/9 | پذیرش: 1403/12/19 | انتشار: 1404/6/15
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
