The Journal of Shahid Sadoughi University of Medical Sciences
مجله علمي پژوهشي دانشگاه علوم پزشكي شهید صدوقی يزد
JSSU
Medical Sciences
http://jssu.ssu.ac.ir
20
journal20
2228-5741
2228-5733
fa
jalali
1400
1
1
gregorian
2021
4
1
29
2
online
1
fulltext
fa
بررسی الگوی متیلاسیون ناحیه پروموتری ژن گاماگلوبین در ناقلین و بیماران مبتلا به تالاسمی بتا با هموگلوبین جنینی بالا در مقایسه با افراد طبیعی
Analysis of Methylation Status in Promoter Region of Γ- Globin Gene in Carrier and Affected Β-Thalassemia Patients with High Level of Fetal Hemoglobin in Comparison with Normal Individuals
ژنتیک
Genetics
پژوهشي
Original article
<div style="text-align: justify;"><strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">مقدمه:</span></span></strong> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">از عواملی که احتمالاً با بیان مجدد ژن گاماگلوبین در بزرگسالی مرتبط است تغییر الگوی متیلاسیون ناحیه پروموتری آن است. هدف از این مطالعه تعیین میزان همراهی الگوی متیلاسیون پروموتر ژن گاماگلوبین با میزان بیان این ژن در بیماران و ناقلین بتا تالاسمی است<strong>.</strong></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"></span></span><br>
<strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">روش بررسی:</span></span></strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> در این مطالعه که بهصورت موردی </span></span><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">–</span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> شاهدی انجام گرفته است. </span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">بعد از گرفتن نمونه خون از 30 بیمار و ناقل تالاسمی بتاگلوبین با هموگلوبین جنینی بالا و 30 فرد نرمال استخراج </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">DNA</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> انجام گردید. سپس نمونههای </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">DNA</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> با سدیم بیسولفیت تیماره شده، 6 جایگاه </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">CpG</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> در محدوده پروموتر و اگزون 1 ژن گاماگلوبین به روش </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">Bisulfite sequencing analysis</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> مورد بررسی قرار گرفت. از آزمون آماری </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">t-test</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> استفاده گردید. مقدار </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">P</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> کمتر از 0/05 به معنای اختلاف معنیدار بین دو گروه انتخاب شد.</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">دادهها به وسیله نرمافزار </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">SPSS version 16</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> تجزیه و تحلیل شد.</span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"></span></span><br>
<strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">نتایج:</span></span></strong> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">در این بررسی هایپومتیله بودن ناحیه پروموتری ژن گاماگلوبین نمونههای بیماران و ناقلین در مقایسه با نمونههای نرمال تفاوت معنیداری در سه جایگاه 6+ ،+53 و 162- مشاهده شد (0/05</span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;"> p<</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">). بهعلاوه در سه نمونه، موقعیت 162- دارای وضعیت نیمه متیله بود که این وضعیت بهطور واضحی متفاوت از دیگر نمونههای بیمار و نرمال بود.</span></span> <span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;"></span></span></span><br>
<strong><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">نتیجهگیری:</span></span></strong> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">هایپومتیلاسیون پروموتر ژن گاماگلوبین احتمالأ عامل کمکی در افزایش هموگلوبین جنینی است.</span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"></span></span></div>
<div style="text-align: justify;"><strong>Introduction:</strong> Among the factors that may be associated with the re-expression gamma-globin in adults is the methylation pattern of the promoter region. The study aimed to determine the association between promoter methylation pattern of the gamma-globin gene in the carriers and affected beta-thalassemia individuals and its expression levels.<br>
<strong>Methods:</strong> This study has been done as a case control- study. After taking blood samples from 30 patients and beta-thalassemia carriers and affected patients with fetal hemoglobin elevated as well as 30 normal individuals, genomic DNA was extracted. Six CpG sites of the promoter region and exon1 of the gamma-globin gene were analyzed by the bisulfite sequencing analysis method. Statistical analysis was carried out using a t-test. The values of <em>p</em> ≤ 0.05 were considered significant for comparing two studied groups. Data were analyzed using SPSS version 16 software.<br>
<strong>Results:</strong> In this study, hypomethylation of the gamma-globin promoter region in the patients and carriers compared to showed a significant differences in three CpG sites +6, -53 and -162, respectively (p<0.05). In addition, in three cases, CpG site in position -162 was semi methylated; this situation was markedly different from other samples of the patients and normal cases.<br>
<strong>Conclusion:</strong> Hypomethylation of the gamma-globin gene promoter probably has an auxiliary role in fetal hemoglobin increase.</div>
بتا تالاسمی, هموگلوبین جنینی, متیلاسیون
Beta- thalassemia, Fetal hemoglobin, Methylation.
3524
3533
http://jssu.ssu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-4240-1&slc_lang=fa&sid=1
Mohammad
Hamid
محمد
حمید
hamid143@yahoo.com