<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>The Journal of Shahid Sadoughi University of Medical Sciences</title>
<title_fa>مجله علمي پژوهشي دانشگاه علوم پزشكي شهید صدوقی يزد</title_fa>
<short_title>JSSU</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://jssu.ssu.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>20</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>journal20</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2228-5741</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2228-5733</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi></journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1400</year>
	<month>2</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2021</year>
	<month>5</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>29</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>فراوانی ژن‌های fimH،papC  وaer در ایزوله های اشرشیا‌کلی جدا شده از بیماران مبتلا به عفونت ادراری یزد و بررسی ‌الگوی مقاومت آنتی‌بیوتیکی آن‌ها</title_fa>
	<title>Frequency of fimH, papC, and aer in E. coli Strains Isolated from Patients with Urinary Tract Infection, and their Antibiotic Resistance Pattern</title>
	<subject_fa>میکروبیولوژی</subject_fa>
	<subject>Microbiology</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Original article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;مقدمه: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;اشریشیاکلی&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; از عوامل اصلی ایجاد کننده عفونت ادراری می&#8204;باشد. این باکتری برای ایجاد عفونت در دستگاه ادراری به چندین ویرولانس فاکتور ازجمله&#8204; ادهزین، توکسین&amp;shy;ها و فیمبریه احتیاج دارد. در مطالعه حاضر، فراوانی چندین ویرولانس فاکتور انتخابی &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;fimH&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;papC&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;aer&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;&#8204; را در ایزوله&#8204;&amp;shy;های اشریشیاکلی&lt;/span&gt; جدا شده از ادرار بیماران مبتلا به عفونت ادراری یزد بررسی کردیم.&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;روش بررسی: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;در این مطالعه توصیفی- مقطعی طی سال 95-94، 146 ایزوله اشریشیاکلی&lt;/span&gt; جدا شده از ادرار بیماران مبتلا به عفونت ادراری یزد جمع&#8204;آوری و به وسیله روش&amp;shy;های فنوتیپی و ژنوتیپی تایید هویت گردید. فراوانی ژن&#8204;های &lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;fimH&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;papC&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;aer&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;را با استفاده از پرایمرهای اختصاصی به&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;روش&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;PCR &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;بررسی و الگوی مقاومت آنتی&#8204;بیوتیکی ایزوله&#8204;&#8204;ها را به روش دیسک دیفیوژن تعیین کردیم.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;نتایج: &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;در مطالعه حاضر، فراوانی ژن&#8204;های ویرولانس انتخابی (87%) &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&#8204;&lt;em&gt;fimH&lt;/em&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;، (85/6%) &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;aer&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;، (9/6%) &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;papC&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; بود. از بین 146 ایزوله &lt;em&gt;اشریشیاکلی&lt;/em&gt;، (57/2%) ایزوله&#8204;ها به کوتریماکسازول، 54/8% به نالیدیکسیک اسید، 45/9% به سفازولین، 40/4% به سفکسیم، 42/5% به سفالوتین، 41/8% به سفالکسین، 31/5% به نوروفلوکساسین، 30/1% به آفلوکساسین، 28/3% به سیپروفلوکساسین، 24% به جنتامایسین، 19/9% به آمیکاسین، 1/4% به نیتروفورانتوئین، 1/4% به فسفومایسین مقاوم بودند. بیشترین مقاومت به کوتریماکسازول وکمترین مقاومت به نیتروفورانتوئین و فسفومایسین مشاهده شد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;نتیجه&#8204;گیری:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt; در این مطالعه درصد فراوانی ژن &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman,serif;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;fimH&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:B Nazanin;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;بالاتر از ژن&#8204;های دیگر مورد مطالعه بود. هم&#8204;چنین بر اساس الگوی مقاومت آنتی&#8204;بیوتیکی، نیتروفورانتوئین و فسفومایسین داروهای مناسبی جهت درمان بیماران در منطقه ما می&#8204;&amp;shy;باشند.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Introduction:&lt;/strong&gt;&lt;em&gt; E. coli&lt;/em&gt; is the predominant causes of urinary tract infection. Several virulence factors for bacterial infections in the urinary tract are required. In this study, we have considered several virulence factors in strains isolated from the patients with UTI in Yazd.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Methods:&lt;/strong&gt; In this cross-sectional study in 2015-2016, 146 strains isolated were collected from the patients with urinary tract infection. After confirmation by phenotypic and genotype methods, frequency of gene &lt;em&gt;fimH&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;pap C, aer&lt;/em&gt; was evaluated using specific primers by PCR method. The pattern of antibiotic resistance of isolates was determined by disk diffusion method&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;.&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results: &lt;/strong&gt;In the present study, the prevalence of virulence genes was &lt;em&gt;fimH&lt;/em&gt; (87%),&lt;em&gt; aer&lt;/em&gt; (85.6%) and &lt;em&gt;papC&lt;/em&gt; (9.6%). Among 146 &lt;em&gt;E. coli &lt;/em&gt;isolates, resistance rate for various antibiotics were as follows: 57.2% to Cotrimoxazole, 54.8% to Nalidixic acid, 45.9% to Cefazolin, 40.4% to Cefixime, 42.5% to Cefalotin, 41.8% to Cefalexin, 31.5% to Norfloxacin, 30.1% to Ofloxacin, 28.3% to Ciprofloxacin, 24% to Gentamicin, 19.9% to Amikacin, 1.4% to Nitrofurantoin, and 1.4% to&amp;nbsp; phosphomycin. The results showed that the most and less frequent resistant was seen in Cotrimoxazole and Nitrofurantoin, phosphomycin, respectively.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusion: &lt;/strong&gt;In this study, the frequency of &lt;em&gt;fimH&lt;/em&gt; gene was higher than other genes. In addition, according to the pattern of antibiotic resistance nitrofurantoin and phosphomycin are suitable medicines for the treatment of patients in our region.&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>اشریشیاکلی, فاکتور های ویرولانس, papC, aer, fimH‌, مقاومت آنتی‌بیوتیکی</keyword_fa>
	<keyword>Escherichia coli, UTI, virulence factor, aer, papC, fimH, Antibiotic Resistance.</keyword>
	<start_page>3556</start_page>
	<end_page>3565</end_page>
	<web_url>http://jssu.ssu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1741-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Zahra</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Abdolahzadeh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>زهرا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عبداله‌زاده</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>zahraab32@yahoo.com</email>
	<code></code>
	<orcid>0000-0002-1401-7415</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Shahid Sadoghi University of Medical Sciences and Health Services, Yazd, Iran. </affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده پزشکی‌، دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی شهید صدوقی یزد، یزد</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Akram</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Astani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>اکرم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>آستانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>astani_ir@yahoo.com</email>
	<code></code>
	<orcid>0000-0002-6915-1320</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Shahid Sadoghi University of Medical Sciences and Health Services, Yazd, Iran. </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی‌، ‌دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی شهید صدوقی یزد، یزد</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ahmad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mosadegh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>احمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مصدق</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>Mosadegh14@yahoo.com</email>
	<code></code>
	<orcid>0000-0002-3695-9681</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Shahid Sadoghi University of Medical Sciences and Health Services, Yazd, Iran. </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی‌، ‌دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی شهید صدوقی یزد، یزد</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Saeede Sadat</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name> Hosseini Mohammad Abadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سعیده السادات</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حسینی محمدآبادی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ss.hosseini69@gmail.com</email>
	<code></code>
	<orcid>0000-0002-9613-1296</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Microbiology, School of Medicine, Shahid Sadoghi University of Medical Sciences and Health Services, Yazd, Iran. </affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده پزشکی‌، دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی شهید صدوقی یزد، یزد</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mahmoud</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Vakili</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمود</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>وکیلی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>vakilim52@yahoo.com</email>
	<code></code>
	<orcid>0000-0002-0113-7100</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Health Monitoring Research Center, School of Medicine, Shahid Sadoughi University of Medical Sciences and Health Services, Yazd, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات پایش سلامت، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی شهید صدوقی یزد، یزد</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
