The Journal of Shahid Sadoughi University of Medical Sciences
مجله علمي پژوهشي دانشگاه علوم پزشكي شهید صدوقی يزد
JSSU
Medical Sciences
http://jssu.ssu.ac.ir
20
journal20
2228-5741
2228-5733
fa
jalali
1396
7
1
gregorian
2017
10
1
25
7
online
1
fulltext
fa
مقایسه پلیمورفیسم ژنومی و ارتباط ژنتیکی سویههای بالینی سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم در استان کرمان به روش ERIC- PCR و Box-PCR
Comparison of Genomic Polymorphisms and Genetic Relation of Clinical Salmonella Enterica Serovar Typhimurium Isolates in Kerman Province by ERIC- PCR and Box-PCR Methods
میکروبیولوژی
Microbiology
پژوهشي
Original article
<strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">مقدمه:</span></span></strong> <span style="font-family:b nazanin;">سالمونلا از مهمترین عوامل ایجادکننده گاستروانتریت در انسان هستند. سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم علاوه بر انسان، میزبان های زیادی داشته و امکان شیوع آن در جامعه بالاست. هدف از انجام این مطالعه، ارزیابی تنوع ژنتیکی سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم جدا شده از نمونه مدفوع انسانی توسط هر دو روش </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ERIC-PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> و </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">BOX-PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> میباشد.</span><br>
<strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">روش بررسی:</span></span></strong> <span style="font-family:b nazanin;">در این مطالعه مقطعی، 60 سویه سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم از نمونه مدفوع انسانی به دست آمد.</span> <span style="font-family:b nazanin;">تمامی سویهها با استفاده از</span> <span style="font-family:b nazanin;">آزمونهای استاندارد میکروبیولوژیکی و بیوشیمیایی تایید شدند.</span> <span style="font-family:b nazanin;">سپس، </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ERIC-PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> و </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">BOX-PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> برای تعیین تنوع ژنتیکی سویههای سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم با پرایمرهای اختصاصی انجام گردید.</span><br>
<strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">نتایج:</span></span></strong> <span style="font-family:b nazanin;">تفکیک</span><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> پلیمورفیسم </span></span><span style="font-family:b nazanin;">60 ایزوله سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم با استفاده از روشهای </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ERIC1</span></span><span style="font-family:b nazanin;">، </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ERIC2</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> و </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">BOXAIR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> انجام گردید. در الکتروفورز 11-2 باند با اندازه 3200-20 باز برای </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ERIC-PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> و 10-2 باند با اندازه 1500-200 باز برای </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">BOX-PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> مشاهده شد؛ بنابراین، 13 کلاستر مختلف (</span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">C1-C13</span></span><span style="font-family:b nazanin;">) در </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ERIC-PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> و 21 کلاستر مختلف در </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">BOX-PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> شناسایی شد.</span><br>
<strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">نتیجهگیری:</span></span></strong> <span style="font-family:b nazanin;">نتایج نشان داد که گونههای سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم گونههای غیر هومولوگ بودند؛ بنابراین، روشهای </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ERIC-PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> و </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">BOX-PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> روش مناسبی برای تایپبندی مولکولی سویههای سالمونلا و تشخیص گسترش منبع عفونت برای بررسی اپیدمیولوژیک و برنامه پیشگیری از عفونت هستند.</span>
<strong>Introduction:</strong> Salmonella is one of the most important causes of gastroenteritis in humans. Salmonella enterica Serovar Typhimurium has many hosts in addition to humans, and its prevalence in the community is high. The aim of the study was comparing the genetic diversity of Salmonella enterica serovar Typhimurium isolated from human fecal samples by both of ERIC-PCR and BOX-PCR method.<br>
<strong>Methods:</strong> In this cross-sectional study, 60 Salmonella enterica serovar Typhimurium were obtained from the human fecal samples. These strains were identified by standard microbiological and biochemical tests. Then, ERIC-PCR and BOX-PCR were carried out for determination of molecular relatedness of Salmonella enterica serovar Typhimurium using specific primers.<br>
<strong>Results</strong><strong><span dir="RTL">:</span></strong> The results showed that all 60 Salmonella enterica serovar Typhimurium were separable using ERIC 1, ERIC 2 and BOXAIR. In electrophoresis, 2-11 bands with 20-3200bp for ERIC-PCR and 2-10 bands with 200-1500bp for BOX-PCR were observed. Therefore, 13 different clusters (C1-C13) in ERIC-PCR and 21 different clusters (C1-C21) in BOX-PCR were identified.<br>
<strong>Conclusion:</strong> The results showed that Salmonella enterica serovar Typhimurium strains were non-homolog. Therefore, ERIC-PCR and BOX-PCR methods are appropriate methods for molecular typing of Salmonella strains and determine the original infection source for the epidemiological survey as well as infection prevention program.
سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم, BOX-PCR و ERIC-PCR
Salmonella enterica serovar Typhimurium, BOX-PCR, ERIC-PCR.
564
571
http://jssu.ssu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2801-1&slc_lang=fa&sid=1
Arghavan
Geranmayeh
ارغوان
گرانمایه
arghavan_geranmayeh@yahoo.com