دوره 32، شماره 1 - ( فروردین 1403 )
جلد 32 شماره 1 صفحات 7470-7459 |
برگشت به فهرست نسخه ها
چکیده: (154 مشاهده)
مقدمه: ویروس نیل غربی عفونتی بوده که از طریق بندپایان خونخوار منتقل می‌شوند. تظاهرات چشمی یکی از ویژگی‌های عفونت ویروس نیل غربی است. آن‌ها بیشتر در ارتباط با بیماری عصبی شدید رخ می‌دهند. در این مطالعه با استفاده از آنالیز بیوانفورماتیک به بررسی و کاندید نمودن ژن‌های موجود در مسیرهای وابسته به عفونت ویروس نیل غربی در شبکیه چشم پرداختیم.
روش بررسی: در این مطالعه با استفاده از روش‌های بیوانفورماتیک و با مراجعه به پایگاه داده GEO دیتاست مناسب برای آنالیز انتخاب گردید. این دیتاست شامل پروفایل بیان ژنی در عفونت ویروس نیل غربی با سلول‌های رنگدانه‌ای شبکیه بود. کلاسترهای ژنی با بیان بالا و پایین دسته‌بندی شدند. برای ارزیابی دقیق‌تر داده از پایگاه‌های داده غنی همچون Enrichr، STRING و Networkanalyst استفاده شد. ژن‌های کاندید شده را جدا نمودیم و ارتباط پروتئینی آن با استفاده از نرم‌افزار cytoescape ورژن 3.7.1 سنجیده شد. مقادیر به‌دست آمده که P˂0.05 به عنوان داده‌های معنی‌دار انتخاب شد.
نتایج: 830 ژن با بیان بالا و 500 ژن با بیان پایین در مسیرهای پیشرفت عفونت ویروسی نیل غربی در چشم نقش دارند. مسیرهای آپوپتوز، نکروپتوزیس، اتوفاژی AMPK و MAPK به‌صورت بارزی مشاهده شدند. پس از ارزیابی ارتباط بین شبکه‌های پروتئینی، RIPK1، STAT1/3 و JAK2 افزایش بیان و ژن‌های GSK3B، MAPK8 و TSC2 کاهش بیان داشتند.
نتیجه‌گیری: مطالعه حاضر نشان داد که پروتیئن‌ها و ژن‌های مهمی در تقویت التهاب ویروس نیل غربی در شبکیه چشم نقش عمده‌ای داشته که از میان آن‌ها RIPK1، TSC2، STAT1 و JAK2 نقش بارزتری را در این مسیر نشان دادند.
روش بررسی: در این مطالعه با استفاده از روش‌های بیوانفورماتیک و با مراجعه به پایگاه داده GEO دیتاست مناسب برای آنالیز انتخاب گردید. این دیتاست شامل پروفایل بیان ژنی در عفونت ویروس نیل غربی با سلول‌های رنگدانه‌ای شبکیه بود. کلاسترهای ژنی با بیان بالا و پایین دسته‌بندی شدند. برای ارزیابی دقیق‌تر داده از پایگاه‌های داده غنی همچون Enrichr، STRING و Networkanalyst استفاده شد. ژن‌های کاندید شده را جدا نمودیم و ارتباط پروتئینی آن با استفاده از نرم‌افزار cytoescape ورژن 3.7.1 سنجیده شد. مقادیر به‌دست آمده که P˂0.05 به عنوان داده‌های معنی‌دار انتخاب شد.
نتایج: 830 ژن با بیان بالا و 500 ژن با بیان پایین در مسیرهای پیشرفت عفونت ویروسی نیل غربی در چشم نقش دارند. مسیرهای آپوپتوز، نکروپتوزیس، اتوفاژی AMPK و MAPK به‌صورت بارزی مشاهده شدند. پس از ارزیابی ارتباط بین شبکه‌های پروتئینی، RIPK1، STAT1/3 و JAK2 افزایش بیان و ژن‌های GSK3B، MAPK8 و TSC2 کاهش بیان داشتند.
نتیجه‌گیری: مطالعه حاضر نشان داد که پروتیئن‌ها و ژن‌های مهمی در تقویت التهاب ویروس نیل غربی در شبکیه چشم نقش عمده‌ای داشته که از میان آن‌ها RIPK1، TSC2، STAT1 و JAK2 نقش بارزتری را در این مسیر نشان دادند.
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
زیست شناسی
دریافت: 1402/4/20 | پذیرش: 1403/1/15 | انتشار: 1403/1/15
دریافت: 1402/4/20 | پذیرش: 1403/1/15 | انتشار: 1403/1/15
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |